Selon l'Université du Wisconsin, le conduit auditif externe sert de passage au son pour atteindre la membrane tympanique, ou tympan ; cependant, le conduit auditif externe remplit également des fonctions non acoustiques. Le conduit protège le tympan des dommages et maintient un passage dégagé vers la membrane tympanique grâce à un processus d'auto-nettoyage.
Il est important que le conduit auditif ne soit pas obstrué afin que les ondes sonores puissent atteindre facilement le tympan. L'Université du Wisconsin explique que garder le canal libre d'obstructions nécessite un processus appelé migration épithéliale. Dans la plupart des autres endroits recouverts de peau, le contact accidentel aide à éliminer les cellules mortes de la peau ; cependant, cela ne fonctionne pas dans le conduit auditif. Au lieu de cela, les cellules de la peau migrent latéralement du tympan vers l'ouverture externe. Il s'agit d'une fonction importante car le matériau impacté peut compromettre l'efficacité de l'oreille.
De nombreuses fonctions de protection du conduit auditif découlent de la structure anatomique de l'oreille. L'Université du Wisconsin déclare que la profondeur du canal et les parois rigides qui le composent confèrent une protection importante au tympan délicat au terminus du canal. De plus, l'oreille produit de la cire et a une abondance de petits poils, qui contribuent tous deux à protéger le tympan des blessures.