Une molécule est un groupe de deux atomes ou plus liés ensemble, tandis qu'un composé est un groupe de deux atomes ou plus liés ensemble où les atomes proviennent d'au moins deux types d'éléments. Tous les composés sont aussi des molécules, mais toutes les molécules ne sont pas des composés.
Par exemple, la formule H2O est à la fois une molécule et un composé, mais H2 n'est qu'une molécule puisqu'elle ne contient que des atomes d'hydrogène. En chimie inorganique, le terme molécule est généralement limité aux composés avec une charge neutre, tandis que le terme ion fait référence aux atomes liés avec une charge positive ou négative.
