Reference.com définit la microbiologie industrielle comme "l'utilisation de micro-organismes dans la fabrication de produits alimentaires ou industriels." La microbiologie industrielle est responsable de la production de nombreux aliments que les humains apprécient, notamment le chocolat, le fromage, saucisse, beurre et cornichons. De plus, ces microbiologistes travaillent dans le traitement des déchets, les produits pharmaceutiques et la production de polymères tels que les plastiques.
Selon la Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, cette industrie applique des principes scientifiques utilisant des bactéries, des algues, des champignons, des protozoaires et des virus ainsi que des cellules végétales ou animales dans la création de processus et de produits utiles. Certaines personnes dans cette industrie travaillent à détecter les microbes dans les aliments ou à prévenir la détérioration des cosmétiques. D'autres développent des souches de bactéries qui aident à libérer le pétrole piégé dans les roches pour l'exploitation minière. Leur travail s'étend aux préoccupations environnementales, car certains développent des microbes pour aider à certains processus de recyclage.
Les emplois de microbiologiste industriel de niveau débutant nécessitent un B.S. diplôme en microbiologie, biotechnologie ou biologie avec une mineure dans une science complémentaire, selon la Society for Industrial Microbiology and Biotechnology. Les chefs de projet dans ce domaine possèdent généralement un diplôme d'études supérieures. La Society for Industrial Microbiology and Biotechnology conseille aux personnes qui aiment assumer diverses responsabilités et résoudre des problèmes difficiles d'envisager une carrière en microbiologie industrielle.