National Geographic spécule que le mont Fuji développe une importante réserve de magma basaltique sur la base d'une augmentation des tremblements de terre notée pour la première fois au début des années 2000. La chaleur et les gaz apportés à la surface par le magma basaltique provoquent ces séismes.
La force destructrice de l'éruption de 1707 a peut-être altéré la structure interne du volcan, ce qui signifie qu'il peut actuellement contenir un type de magma différent de celui qu'il contenait dans le passé, lorsque le volcan entrait en éruption assez régulièrement tous les 30 ans. Le gouvernement japonais craint que la dormance actuelle de la montagne ne lui permette de s'approvisionner en un type de magma plus explosif.
