L'Université de Mansoura explique que les produits finaux de la digestion des protéines dans l'intestin grêle sont des acides aminés. Les acides aminés sont ensuite absorbés dans la circulation sanguine à travers les parois de l'intestin à l'aide de protéines porteuses ou d'autres mécanismes. Cette digestion est au terme d'un processus en plusieurs étapes au cours duquel les protéines sont dénaturées et progressivement brisées en leurs peptides constitutifs par une séquence d'enzymes.
L'Université de Mansoura affirme que la première étape chimique vers la digestion des protéines se produit dans l'estomac. L'estomac est le premier organe à stocker les aliments solides, sur lesquels il libère le suc gastrique, un mélange d'acide chlorhydrique et d'enzymes. L'acide commence le processus de dénaturation, qui est la rupture du repliement secondaire et tertiaire des protéines. Il active également la pepsine, une enzyme importante qui attaque les protéines. Plus précisément, la pepsine brise la liaison peptidique en acides aminés aromatiques. Au moment où les protéines quittent l'estomac, elles sont divisées en gros polypeptides et autres composés, tels que les protéoses et les peptones.
Une fois dans l'intestin grêle, les sucs pancréatiques et intestinaux sont libérés et contiennent plus d'enzymes. L'Université de Mansoura explique que chaque enzyme du suc pancréatique agit sur une catégorie différente d'acides aminés et que chaque enzyme du suc intestinal agit sur des polypeptides de longueurs différentes.
