L'un des objectifs des organites liés à la membrane est de permettre l'isolement et la concentration d'enzymes et de réactifs dans un petit espace. Cela permet aux réactions chimiques dans une cellule de se produire plus rapidement et avec une plus grande efficacité. Les organites liés à la membrane peuvent également confiner des protéines et des molécules nocives du reste de la cellule.
Le lysosome est un exemple d'organite membranaire qui aide à protéger la cellule des protéines et molécules nocives par confinement. L'organite abrite de nombreuses enzymes impliquées dans la digestion des lipides, des protéines et des acides nucléiques. Bien que ces enzymes remplissent une fonction importante au sein du lysosome, elles pourraient détruire les lipides, les protéines et les acides nucléiques si elles étaient libérées dans le liquide intracellulaire, appelé cytosol, provoquant la mort de la cellule. La présence de la membrane entourant le lysosome empêche que cela se produise en maintenant les enzymes à l'intérieur de l'organite.
D'autres exemples d'organites liés à la membrane incluent les mitochondries, l'appareil de Golgi et le réticulum endoplasmique. Les mitochondries possèdent chacune deux membranes, la membrane interne se repliant en crêtes. Ces crêtes servent de sites de génération d'adénosine triphosphate, ou ATP. L'appareil de Golgi est responsable de la transformation des protéines fabriquées dans le réticulum endoplasmique. Le réticulum endoplasmique est la zone de la cellule où sont fabriqués les lipides, la plupart des membranes cellulaires, les protéines sécrétées et les protéines transmembranaires.
