Les stromatolites sont de grandes formations rocheuses qui ont été formées par la croissance de plusieurs couches de bactéries sur une très longue période de temps. Ceux-ci prennent généralement la forme de monticules, de colonnes et de feuilles. Les cyanobactéries, des microbes unicellulaires capables d'effectuer la photosynthèse, se développent en ces stromatolites. Il existe de nombreuses couches différentes pour les différents types de formations que les stromatolites peuvent prendre.
Les stromatolites se forment lorsque les bactéries présentes dans certaines régions continuent de s'accumuler et de se former couche après couche. Cela se produit généralement dans des zones où de nombreuses cyanobactéries différentes sont présentes et où les mouvements naturels de l'environnement se prêtent à ce type de développement de couches. Les endroits avec beaucoup d'eau, comme les lacs, les rivières et même certains types de sol, abritent souvent des cyanobactéries. Bien que les stromatolites soient constitués de bactéries, ils sont complètement procaryotes, ils n'ont donc pas d'ADN.
La création de formations de stromatolites prend beaucoup de temps, car il s'agit d'un processus extrêmement graduel nécessitant des milliers et des milliers de ces bactéries. Les stromatolites modernes sont détruits par le broutage des escargots, des vers et d'autres types d'animaux qui peuvent survivre sur les organismes unicellulaires qui les composent.