Les vacuoles contractiles chez les protistes collectent les déchets accumulés et l'excès d'eau à l'intérieur de la cellule. Ils expulsent ces déchets dans l'environnement en se fixant à la paroi cellulaire, puis en se contractant pour libérer ces produits à l'extérieur de la cellule .
Les vacuoles contractiles chez les protistes sont importantes pour la vie de l'organisme. En tant qu'organismes unicellulaires, les protistes sont sensibles aux changements de pression osmotique, aux grandes variations de température et de pH et à l'exposition à différents produits chimiques dans leur environnement. Les vacuoles contractiles régulent le contenu de la cellule, la pression osmotique et l'environnement interne en expulsant du matériel inutile voire délétère à la survie de l'organisme.