Les bernard-l'ermite utilisent leurs carapaces pour se cacher des prédateurs comme les mouettes, les plus gros crabes, les étoiles de mer et les escargots. Ces animaux sont les plus vulnérables lorsqu'ils laissent une carapace pour une autre, ce qu'ils doivent faire comme ils grandissent parce que leurs coquilles ne grandissent pas avec eux. Cependant, certains prédateurs peuvent soit mordre à travers la carapace dure, soit retirer le crabe et le manger.
Les poissons tels que les gunnels et les clingfish comptent parmi les prédateurs du bernard-l'ermite, mais ces crabes ne sont pas en sécurité une fois qu'ils quittent l'eau. Les oiseaux tels que les corbeaux et les animaux terrestres tels que les ratons laveurs se nourrissent également de ces petits animaux. Les bernard-l'ermite utilisent des coquilles pour se protéger et, selon Scientific American, ils peuvent creuser des coquilles trop petites pour laisser plus d'espace pour se développer. Cependant, ces coquilles évidées sont plus faciles à écraser pour les prédateurs.
Selon le Smithsonian Magazine, les bernard-l'ermite peuvent également être cannibalisés par leur propre espèce. Les chercheurs ont montré que ces animaux, plutôt que d'être repoussés par l'odeur d'autres bernard-l'ermite morts, sont en fait attirés par l'odeur. Cela les met en danger de prédation par le même animal qui a tué le crabe qui a libéré l'odeur, mais ils peuvent aussi finir par manger des restes en échange du risque.
