Le krill est mangé par les baleines, les pingouins, les phoques, les calmars, les poissons et les humains. Bien que le krill soit également consommé par des centaines d'autres animaux, ce sont leurs plus grands prédateurs. Les baleines mangent la plus grande quantité de krill; le rorqual bleu peut manger jusqu'à quatre tonnes de krill par jour. Le régime alimentaire des manchots Adélie se compose principalement de krill, bien que les 17 espèces de manchots dépendent du krill pour survivre.
Les petites espèces de phoques dépendent du krill pour survivre, tandis que les plus gros phoques, comme le phoque léopard, mangent principalement d'autres animaux, comme les manchots et les jeunes phoques. La majorité du krill est capturé dans l'Arctique, mais leur nombre a diminué d'au moins 80 pour cent depuis les années 1970. Pour cette raison, la pêche au krill est désormais surveillée pour protéger la population en déclin.
Le déclin du krill est causé par des perturbations de leur écosystème, telles que le réchauffement climatique et le changement climatique. L'augmentation des températures arctiques dues au réchauffement climatique a entraîné la formation de moins de glace de mer, ce qui a entraîné moins de nourriture pour le krill, car il mange les algues qui poussent sous la glace de mer. Une autre cause du déclin de la population de krill a été causée par une baisse de la concentration de diatomées dans la mer de Béring survenue en 1998 lors d'une prolifération de coccolithophores. Les coccolithophores font également partie du régime alimentaire du krill, et la baisse de concentration les a fait devenir plus petits. Kill est incapable de se nourrir du plus petit coccolithophore, ce qui réduit la disponibilité de nourriture pour le krill.
