Les cobayes dorment généralement les yeux ouverts. Les animaux ferment très rarement les yeux, même lorsqu'ils dorment. Ils reposent la tête sur le sol pour dormir et s'étendent parfois les jambes tendues.
Les cobayes sont des proies vulnérables dans la nature. Ils font de courtes siestes fréquentes tout au long de la journée et de la nuit, et même alors, ils ne ferment pas les yeux. Ce comportement est tout à fait normal et est dû à leur position basse dans la chaîne alimentaire. C'est simplement un mécanisme de défense pour les protéger des prédateurs à tout moment. Certains cobayes ferment effectivement les yeux lorsqu'ils dorment, mais ce comportement n'est pas la norme. C'est souvent un signe de relaxation profonde et un sentiment de sécurité et ne signifie pas une mauvaise santé.