Drugs.com indique que la prise de poids fait partie des effets secondaires courants du millepertuis, aux côtés des étourdissements, de la bouche sèche, d'une plus grande sensibilité au soleil, de l'agitation et de la fatigue. Les personnes qui utilisent le St. John's le moût n'éprouve généralement aucun effet secondaire ou seulement des effets secondaires mineurs.
Selon le National Center for Complementary and Alternative Medicine, le millepertuis n'est pas efficace comme traitement pour le trouble dépressif majeur de degré modéré. Le produit est cependant l'un des produits botaniques les plus vendus aux États-Unis. Les médecins et les herboristes utilisent l'extrait de la plante depuis l'Antiquité pour calmer les patients et traiter les troubles mentaux et les douleurs nerveuses.