Selon l'American Society of Microbiology, les antiseptiques agissent en modifiant le pH de l'environnement des bactéries, rendant l'environnement habitable. Étant donné que les micro-organismes s'adaptent à leur environnement, les antiseptiques doivent agir rapidement pour tuer la bactérie avant qu'elle n'ait une chance de s'adapter.
Le corps est capable de combattre naturellement la plupart des types de bactéries. En fait, c'est l'exposition aux bactéries qui aide le corps à développer une résistance à celles-ci. Des études indiquent que l'utilisation d'antibiotiques, d'antiseptiques et d'autres produits destructeurs de germes chez les enfants contribue fortement au développement d'allergies plus tard dans la vie.
Selon les Centers of Disease Control and Prevention, l'une des plus grandes préoccupations dans le domaine médical est un groupe de micro-organismes qui développent une résistance aux antiseptiques et aux antibiotiques. En raison du taux rapide de mutation et des temps de prolifération, il est à craindre qu'une très petite colonie de bactéries résistantes aux antiseptiques et aux antibiotiques ait le potentiel de devenir rapidement une grande colonie. De telles bactéries sont susceptibles de donner naissance à une nouvelle forme d'agent pathogène qui possède une résistance naturelle à la médecine moderne. Cela fonctionne à peu près de la même manière qu'une personne ne prenant que la moitié de ses antibiotiques, donnant naissance à ce que les scientifiques et les médecins appellent des super-bactéries, qui sont devenues résistantes aux antibiotiques.
