La prise de pilules contraceptives pendant la grossesse est sans danger, mais cela ne présente aucun avantage, explique Mayo Clinic. Les minipilules ou les pilules contraceptives combinées ne semblent pas augmenter le risque de malformations congénitales, mais il y a risque accru que l'ovule fécondé s'implante en dehors de l'utérus, entraînant une grossesse extra-utérine.
Si une femme soupçonne qu'elle est enceinte pendant qu'elle prend des pilules contraceptives, elle doit arrêter de prendre la pilule jusqu'à ce que la grossesse soit confirmée ou exclue. Certaines recherches ont suggéré qu'il existe un lien entre l'utilisation de pilules contraceptives près de la conception avec un risque accru d'insuffisance pondérale à la naissance, d'anomalies congénitales des voies urinaires ou d'accouchement prématuré. Cependant, le lien n'a été observé dans aucun essai clinique, selon l'expert médical Roger W. Harms de la Mayo Clinic.