Le système digestif maintient l'homéostasie en créant le bon équilibre du pH dans l'environnement gastrique. De plus, en maintenant le bon rapport enzymatique, le système digestif nourrit des bactéries bénéfiques qui inhibent la maladie et produisent des substances biologiques besoins du corps tels que la vitamine K.
L'homéostasie est l'équilibre que le corps maintient pour continuer à fonctionner correctement. Tous les systèmes corporels, y compris le système digestif, contribuent à l'homéostasie. Le corps maintient l'homéostasie en utilisant à la fois des mécanismes positifs et négatifs. La rétroaction négative se produit lorsque le corps détecte un déséquilibre et que les divers systèmes travaillent pour contrebalancer et rétablir un bon équilibre. La rétroaction positive se produit lorsque le corps ressent un changement et s'efforce de l'améliorer.
L'équilibre du pH du corps, son rapport acide/alcalin, est une partie importante de l'homéostasie globale. En bouche, la salive n'est que légèrement acide. Cependant, le système digestif a besoin et maintient un environnement très acide dans lequel décomposer rapidement les aliments. Parallèlement à la régulation de l'équilibre du pH, le système digestif maintient la microflore telle que l'acidophilus et la bifidobactérie qui décomposent les agents cancérigènes et autres infections. Après avoir décomposé les aliments à travers un système complexe semblable à un convoyeur, le système digestif transmet les nutriments nécessaires au système circulatoire pour qu'ils soient absorbés par le corps.
