La crise des missiles cubains a été résolue lorsque les États-Unis ont promis de ne jamais envahir Cuba et de démanteler leurs missiles Jupiter en Italie et en Turquie en échange du retrait des missiles soviétiques à Cuba. La seconde moitié de l'accord était secret à l'époque et n'a été révélé que des années après la fin de la crise. La résolution est intervenue quelques jours à peine avant qu'une action militaire n'aggrave la crise.
Au début de la crise, les conseillers du président Kennedy ont demandé des frappes aériennes pour éliminer les missiles à Cuba. Kennedy était réticent, cependant, en raison du risque d'escalade du conflit et d'invitation à des représailles de la part de l'Allemagne. Après que les efforts diplomatiques aient montré peu de succès, les États-Unis ont institué un blocus, empêchant tout navire transportant des armes d'atteindre les côtes cubaines. En fin de compte, les deux pays sont revenus aux négociations par le biais de communications indirectes, résolvant la crise de manière pacifique.
Le blocus de l'Atlantique s'est avéré être le moment le plus dangereux de la crise. Après avoir découvert un sous-marin soviétique tentant d'escorter un navire à travers la ligne, la marine américaine a lancé des grenades sous-marines d'avertissement sur le navire pour tenter de le faire remonter à la surface ou de faire demi-tour. Le capitaine du sous-marin, cependant, avait une torpille à pointe nucléaire et la permission de la tirer si on lui tirait dessus. Lorsque les grenades sous-marines ont commencé à exploser, les officiers ont eu une vive discussion pour savoir s'il fallait ou non riposter. En fin de compte, ils n'ont pas pu accepter de tirer la torpille, et leur désaccord a potentiellement évité une guerre nucléaire mondiale.