La cause de la mort de John Hancock n'est pas connue. On sait cependant qu'il avait la goutte et que sa santé s'était dégradée plusieurs années avant sa mort. Il mourut à son domicile en 1793 à l'âge de 56 ans alors qu'il était encore gouverneur du Massachusetts.
Bien que John Hancock ait joué un rôle essentiel dans l'organisation des colonies et la fondation des États-Unis, il est surtout connu pour sa signature. Il est difficile de manquer la signature de John Hancock lors de l'examen d'une copie de la déclaration d'indépendance. C'est facilement le plus lisible et reconnaissable sur le document. Au moment de la signature, Hancock était le président du Congrès continental. En tant que tel, il a été le premier à signer le document. La légende raconte que Hancock a signé son nom si hardiment parce qu'il voulait s'assurer que le roi d'Angleterre pourrait lire son nom sans lunettes. À ce jour, la demande de « mettre votre John Hancock » sur un document est une façon de demander à quelqu'un de le signer. Bien que Hancock ait eu des aspirations présidentielles au moment d'élire des responsables pour gouverner les États-Unis nouvellement formés, il a été battu par George Washington lors de la première élection présidentielle.