Les enzymes fonctionnent en créant un emplacement pour que les molécules se lient ou se séparent, appelé site actif. Lorsqu'une molécule pénètre dans le site actif, une réaction chimique a lieu. La vitesse à laquelle la réaction chimique se produit est déterminée par l'action de l'enzyme. Différentes enzymes sont situées dans différentes zones du corps, chaque enzyme n'agissant que sur un seul type de molécule.
La fonction enzymatique est contrôlée par des inhibiteurs et des activateurs. Les inhibiteurs ralentissent ou arrêtent la réaction de l'enzyme. Ils modifient la forme de l'enzyme afin qu'elle n'accepte pas une molécule ou qu'elle l'accepte plus lentement. Les activateurs sont à l'opposé des inhibiteurs. Ils accélèrent l'activité des enzymes. Les hormones sont souvent utilisées pour activer les enzymes.
Les enzymes peuvent être altérées par la température et par l'acidité de l'environnement. Chaque enzyme fonctionne mieux dans une plage de température optimale. Les températures en dehors de cette plage peuvent modifier la forme de l'enzyme de sorte qu'elle ne soit plus utilisable. Chaque enzyme fonctionne également à un niveau d'acidité idéal, appelé niveau de pH. Si une enzyme est placée dans un environnement avec un pH incorrect, la forme de l'enzyme change et elle ne peut plus fonctionner.