Il peut être difficile de déterminer le nombre exact de lémuriens restants dans le monde, car de nouvelles espèces sont continuellement découvertes. Cependant, la plupart des espèces sont considérées comme en danger et en danger critique d'extinction et une espèce est en voie d'extinction.
Les lémuriens font partie des espèces de mammifères les plus menacées au monde, selon une étude menée par la Commission de la survie des espèces de l'Union internationale pour la conservation de la nature en 2012. Une espèce, le lémurien sportif du nord, est si proche de l'extinction que seule 18 individus restent à l'état sauvage. Sur les 103 espèces de lémuriens connues dans le monde, 93 font face à un certain niveau de menace. Sur ces 93 espèces menacées, 19 sont répertoriées comme « vulnérables », 52 sont classées comme « en danger » et 23 sont décrites comme « en danger critique d'extinction », ce qui signifie qu'elles sont particulièrement vulnérables à l'extinction. Seules trois espèces ne sont pas considérées comme menacées.
En 2005, 41 espèces de lémuriens étaient considérées comme « vulnérables », « en danger » ou « en danger critique d'extinction ». La forte augmentation des effectifs de 2012 est due à deux facteurs importants : l'augmentation des niveaux de menace et la découverte de plusieurs nouvelles espèces de lémuriens.
La plus grande menace pour les lémuriens est la destruction de leur habitat. Leur habitat est limité à l'île de Madagascar. Les forêts tropicales où ils vivent sont menacées par l'exploitation forestière illégale, l'exploitation minière illégale et les problèmes politiques. Les lémuriens sont également menacés par les braconniers.
Bien que de nombreuses espèces soient confrontées à des menaces majeures, certaines espèces se sont rétablies. Par exemple, la population de grands hapalémurs est passée de 100 individus à 500 individus.
