Les zygotes humains normaux ont tous 46 chromosomes organisés en 23 paires, soit le même nombre que la plupart des humains adultes. Ensemble, ces 46 chromosomes contiennent environ 25 000 gènes, selon le National Human Genome Institut de recherche. Parfois, les embryons humains se développent avec un chromosome supplémentaire qui influence le développement du syndrome de Down.
NHGRI souligne une distinction entre les 22 premières paires de chromosomes, ou autosomes, et la dernière paire appelée "chromosomes sexuels". Chaque être humain possède un ensemble complet d'autosomes dès la conception et les porte donc tout au long de la phase zygote de la gesticulation. Certaines personnes sont conçues avec un chromosome sexuel de moins. Cette condition, connue sous le nom de syndrome de Turner, se traduit toujours par un zygote féminin, car le chromosome manquant est toujours le chromosome mâle, ou « Y ».
De telles anomalies numériques ne sont cependant pas présentes dans la majorité des zygotes en développement, et la majorité des humains portent le complément normal de 46. Fait intéressant, ce nombre est deux de moins que le complément porté par la plupart des singes. Le bureau des sciences du ministère de l'Énergie décrit la façon dont le chromosome humain numéro deux semble être organisé comme s'il résultait de la fusion d'une paire ancestrale de chromosomes, qu'il identifie comme étant l'explication la plus parcimonie de la différence de nombre de chromosomes entre les humains. et les singes.