L'électrophorèse, également appelée électrophorèse sur gel, est utilisée pour séparer les macromolécules d'ADN, d'ARN et de protéines. L'ADN et l'ARN sont séparés en fonction de leur taille et de leur longueur, tandis que les protéines sont séparées en fonction de leurs charges.
L'électrophorèse est utilisée dans l'ADN pour les empreintes digitales à des fins médico-légales, les tests de paternité, la vérification des réactions PCR, la détection de maladies et la recherche de relations évolutives entre les organismes. Une solution de molécules d'ADN chargées négativement est extraite du gel à l'aide d'un champ électrique. Les molécules d'ADN plus petites sont tirées à travers le gel plus rapidement que les molécules d'ADN plus grosses. Cela crée une série de bandes qui contiennent des molécules d'ADN de différentes tailles. Les bandes qui sont éloignées du début du gel sont celles qui contiennent les plus petits fragments d'ADN, tandis que les bandes qui contiennent les plus gros fragments d'ADN sont situées le plus près du début du gel.
Une variété de gels d'électrophorèse sont utilisés pour déterminer les informations fournies par les protéines, et le type de gel utilisé est déterminé par les informations nécessaires. Les protéines contiennent une variété d'acides aminés qui agissent comme les éléments constitutifs de la structure des protéines. Le nombre d'acides aminés que contiennent les protéines et les modifications chimiques qui sont attachées aux protéines déterminent leur taille. Les protéines ont également des charges différentes en fonction du type de protéine en question.