Les types de protozoaires sont les sarcodines, les mastigotes, les sarcomastigotes et les apicomplexes. Les protozoaires sont des organismes unicellulaires qui ont des noyaux et agissent un peu comme des animaux. Les protozoaires vivent généralement près des sources d'eau.
Les sarcodines, ou amiboïdes, se composent des amibes et de leurs proches. Ces protozoaires se déplacent au moyen de pseudopodes, qui sont des projections de leur cytoplasme. Les pseudopodes peuvent également aider les amiboïdes à se nourrir en entourant et en engloutissant une source de nourriture. Les mastigotes sont les flagellés qui se déplacent à l'aide de structures appelées flagelles, qui sont des extensions en forme de fouet. Les sarcomastigotes, ou ciliés, se déplacent à l'aide de cils, qui ressemblent à de minuscules poils qui battent d'avant en arrière en rythme. Les paramécies sont des exemples de sarcomostigotes. Les apicomplexes, historiquement appelés sporozoaires, sont un sous-groupe de protozoaires constitué uniquement d'espèces parasites. L'espèce de plasmodium qui cause le paludisme est un apicomplexe.