Le Bouclier canadien abrite des orignaux, des caribous, des ours, des rats musqués, des loups, des marmottes, des orignaux, des ratons laveurs, des castors, des coyotes, des renards, des carcajous, des belettes, des cerfs, des visons et des loutres. Saumon atlantique, huit espèces différentes de baleines, phoques, achigans dorés, achigans à grande bouche, maskinongés et brochets sont des créatures que l'on trouve couramment dans les eaux voisines.
La faune du Bouclier canadien dépend fortement des lacs de la région comme source d'eau potable et comme habitat pour certains. Ces zones sont peuplées d'oiseaux marins, tels que les plongeons et les hérons. Les lacs sont souvent exceptionnellement clairs en raison d'un manque de végétation. La végétation ne pousse pas car la roche granitique sous les lacs ne se dissout pas, ce qui entraîne un manque de ressources alimentaires minérales pour les bactéries, les algues et le plancton, nécessaires à la croissance de la végétation.
Les arbres abattus sont la principale source de nourriture pour les poissons. Les castors mâchent des arbres qui tombent sur les rives, fournissant des minéraux et des nutriments à la croissance de la végétation. Ces zones fournissent de la nourriture, ainsi qu'une protection pour les poissons. Les rives avec des arbres tombés sont également des terrains de chasse courants pour les poissons, en raison des nombreuses crevasses qui peuvent être utilisées pour tendre des embuscades aux proies. Les berges sont également des lieux de pêche idéaux pour les petits mammifères, tels que les rats musqués, les loutres et les castors.
