L'Alabama abrite un grand nombre d'espèces indigènes, notamment des sangliers, des cerfs de Virginie, des lynx roux, des renards roux et gris, des coyotes, des loutres de rivière d'Amérique du Nord, des mouffettes, des ratons laveurs, des opossums et des tatous. L'Alabama abrite également une population diversifiée d'oiseaux, d'insectes et de reptiles.
Certaines espèces qui se trouvaient autrefois en Alabama ont été chassées de l'État, comme l'élan, le bison, le loup roux et le couguar. Certaines autres espèces, comme l'ours noir, s'y trouvent encore en 2014, mais en petit nombre. Il y a également eu des observations non confirmées du jaguarundi, un petit chat ressemblant à une loutre. Pendant l'été, le lamantin en voie de disparition peut être trouvé dans les eaux côtières. La perruche de Caroline a été trouvée dans tout l'Alabama, mais a été entraînée à l'extinction par la perte de son habitat.
L'Alabama est également connu pour sa pêche au gros, en particulier son poisson-chat et ses écrevisses. Cent cinquante-huit espèces différentes d'oiseaux se reproduisent régulièrement en Alabama, tandis que 174 espèces supplémentaires y hivernent. Ceux-ci incluent les dindes sauvages, les oiseaux de proie, tels que les crécerelles et les faucons, les oiseaux de rivage, les pics et les plongeons. L'État compte également 62 espèces de mammifères et 93 espèces de reptiles, dont l'alligator américain dans les parties sud de l'État. On pense que le serpent indigo oriental a disparu de l'Alabama, mais a été réintroduit à partir de 2010.
