De nombreux oiseaux, reptiles, amphibiens et mammifères de la forêt tropicale sont en voie de disparition. Il s'agit notamment d'animaux familiers, tels que les chimpanzés d'Afrique centrale, et d'animaux relativement inconnus, tels que la grenouille éléphant d'Australie. Les forêts tropicales humides abritent plus d'espèces que tout autre habitat terrestre.
Les oiseaux de forêt tropicale en voie de disparition comprennent la jacinthe et les aras de Lear d'Amérique du Sud et le cacatoès à huppe jaune d'Indonésie. La destruction de l'habitat est un problème sérieux pour beaucoup de ces oiseaux, mais certains d'entre eux, en particulier l'ara hyacinthe, ont également connu des déclins de population en raison de la collecte pour le commerce des animaux de compagnie.
Les populations mondiales d'amphibiens sont en déclin depuis plusieurs années. La grenouille dorée et la mantille dorée sont toutes deux des amphibiens en voie de disparition du sol de la forêt tropicale. Les causes du déclin des amphibiens ne sont pas claires dans tous les cas et peuvent provenir de la combinaison de la destruction de l'habitat, des champignons, du changement climatique et de la collecte.
Des mammifères tels que le rhinocéros de Java et le tigre de Sumatra sont menacés d'extinction. Tous deux sont chassés pour leurs prétendues propriétés médicinales, mais ils sont également confrontés à des habitats de plus en plus fragmentés. Le paresseux à trois doigts à crinière et le paresseux pygmée à trois doigts sont deux autres animaux qui disparaissent de leurs habitats de forêt tropicale humide.
