La ligne 2 en direction du Bronx dessert l'entrée du zoo sur la rivière Bronx, également identifiée comme la porte B. Les passagers doivent descendre à la station Pelham Parkway et se diriger vers l'ouest jusqu'à l'entrée. Le train express de la Septième Avenue (la ligne 2) dessert toutes les gares de Manhattan les plus fréquentées, y compris la 42e et Times Square.
Les passagers doivent toujours vérifier auprès de la Metropolitan Transportation Authority les interruptions de service et les heures d'ouverture. Le zoo du Bronx est également accessible en bus. L'express BxM11 s'arrête le long de Madison Avenue à Manhattan et va directement à la porte B. Depuis le Queens, les bus Bx9 et Bx19 s'arrêtent à l'entrée piétonne du zoo sur la 183rd Street et Southern Boulevard.
