Les enzymes sont classées en six types : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases et ligases. La classification des enzymes est basée sur la réaction chimique que l'enzyme catalyse.
Les enzymes classées comme oxydoréductases effectuent des réactions d'oxydation et de réduction, au cours desquelles un substrat est oxydé et un autre est réduit. Les transférases déplacent des groupes fonctionnels d'une molécule à une autre. Les hydrolases rompent les liaisons simples entre les atomes en ajoutant une molécule d'eau. Les lyases transfèrent des groupes amino, de l'eau ou de l'ammoniac pour former ou éliminer une double liaison au sein d'une molécule. Les isomérases modifient la position des groupes fonctionnels de sorte que le substrat et le produit sont des isomères l'un de l'autre, ce qui signifie qu'ils contiennent le même nombre d'atomes. Enfin, les ligases catalysent des réactions chimiques en éliminant une molécule d'eau pour créer des liaisons simples.