Dans l'histoire contemporaine, l'éducation physique aux Philippines est devenue le Bureau de l'éducation physique et des sports scolaires. La série de décrets exécutifs n° 81 de 1999 a ensuite intégré le BPESS à la Commission des sports des Philippines, qui a depuis assumé les rôles départementaux de BPESS.
Avant la fondation du BPESS ou du PSC, le développement de l'éducation physique aux Philippines était mené par l'un des trois bureaux du personnel de son ministère de l'Éducation, de la Culture et des Sports. Appelé DECS, le département a commencé sous le nom de ministère de l'Éducation, de la Culture et des Sports en vertu de la loi nationale sur l'éducation de 1982. Au début du XXe siècle, les organisations sportives étaient cultivées parallèlement à des programmes éducatifs parrainés simultanément par le gouvernement, notamment le Philippine Amateur. Fédération d'Athlétisme et Département de l'Instruction Publique.
Adoptée en 1990, la loi de la République 6847 est devenue la loi sur la Commission des sports des Philippines lors de sa création en tant qu'institution sportive gouvernementale principale, et elle continue de fonctionner avec le ministère de l'Éducation en collaborant à des programmes d'éducation physique accrédités au niveau national. Le ministère de l'Éducation et la Commission des sports des Philippines coopèrent en outre pour organiser des événements sportifs annuels tels que le Paralong Pambansa, auquel participent des étudiants-athlètes de tout le pays.