Le gel d'agarose est utilisé dans le processus d'électrophorèse, qui sépare les fragments d'ADN en fonction de leur structure et de leurs dimensions Les molécules d'ADN sont généralement digérées avec des enzymes de restriction, et l'électrophorèse sur gel d'agarose sert d'outil de diagnostic pour aider les chercheurs à visualiser des fragments. Le gel d'agarose est une substance épaisse et visqueuse, composée de matrices de polysaccharides, qui capture essentiellement les molécules transportées par les courants électriques.
La technique d'électrophorèse sur gel d'agarose a plusieurs applications importantes. Cette méthode est utilisée en médecine légale, ainsi que dans les laboratoires chimiques et dans les domaines pharmaceutiques et médicaux. Selon l'ASU, le gel d'agarose permet aux gens d'analyser des fragments d'ADN résultant de la digestion enzymatique de morceaux d'ADN plus gros. Le gel permet une visualisation claire des fragments, ce qui est essentiel pour déterminer la taille des particules dans de nombreux domaines de recherche. Lorsque les molécules d'ADN sont placées sur des champs avec des courants électriques, les molécules chargées négativement migrent vers l'extrémité positive du champ, qui contient un gel d'agarose chargé positivement. Le gel est un réseau matriciel réticulé qui sert de maille ou d'écran tridimensionnel pour attirer les molécules d'ADN chargées négativement. Ces molécules sont attirées vers l'extrémité positive de la base du gel par les courants, mais rencontrent la résistance de l'agarose, qui isole alors les molécules d'ADN.