Le système excréteur d'un ver est différent car il possède des organes excréteurs dans presque tous les segments de son corps. Le système est composé de tubes enroulés appelés néphridies qui s'ouvrent dans la cavité corporelle.
Chaque segment alimente un tube principal appelé néphridiostome, qui transporte ensuite les déchets à l'extérieur du corps une fois que tous les nutriments utiles sont retirés des fluides et transmis le long du corps jusqu'à la fin. Le système excréteur a le double devoir d'éliminer les déchets et de fonctionner comme un rein. Les canaux qui constituent une autre partie du système sécrètent une solution saline pour maintenir l'équilibre salin du corps du vers.