Les couleurs des yeux de la mère et du père déterminent en partie la couleur des yeux d'un bébé, explique BabyMed. Cependant, de nombreux gènes travaillent ensemble pour affecter la couleur des yeux, il n'y a donc pas de règles simples à l'hérédité.
La couleur des yeux est un trait polygénique ; cela signifie que de nombreux gènes travaillent ensemble pour l'influencer. La génétique réelle des couleurs des yeux des parents joue un grand rôle, selon BabyMed. Par exemple, si les deux parents sont homozygotes pour les yeux bruns, ce qui signifie qu'ils ont chacun deux copies du gène des yeux bruns, ils pourraient s'attendre à des enfants aux yeux bruns. Mais si les parents sont hétérozygotes pour la couleur des yeux, c'est-à-dire qu'ils ont chacun un gène marron et un gène bleu, ils pourraient s'attendre à ce que certains enfants aient les yeux bleus.
La couleur des yeux dépend également des ratios et des quantités de types de mélanine déposés sur l'œil. L'eumélanine est un pigment brun foncé et la phéomélanine est brun rougeâtre, et la manière dont elles se produisent dans l'iris détermine la couleur des yeux. Cela signifie que si la production et la dispersion du pigment ne fonctionnent pas correctement chez un individu, la personne pourrait avoir les gènes des yeux bruns mais physiquement les yeux bleus. Cela explique les cas de deux parents aux yeux bleus ayant des enfants aux yeux verts, noisette ou marron, rapporte John H. McDonald de l'Université du Delaware.