L'isolement géographique fait référence à la séparation de deux populations de la même espèce en raison d'un certain type de barrière physique. Cette séparation de population se produit lorsqu'un plan d'eau ou de terre se forme et divise un habitat. L'isolement géographique d'une espèce peut également se produire lorsque des animaux migrent vers une île isolée.
Un exemple de population séparée à l'isolement géographique sont les pinsons américains qui ont migré vers les îles hawaïennes. De cette population originale de pinsons, 23 nouvelles espèces de lianes sont des preuves de spéciation en raison de l'isolement géographique.
Cependant, l'isolement géographique peut également entraîner une réduction du flux génétique, car ces populations séparées d'animaux ou d'organismes ne peuvent pas s'accoupler et échanger du matériel génétique. Les scientifiques pensent que l'isolement géographique et reproductif est à l'origine de la formation de nouvelles espèces.