L'organite qui modifie et conditionne les protéines est l'appareil de Golgi. Cet organite comprend plusieurs sacs aplatis appelés citernes. L'appareil de Golgi, également appelé corps de Golgi ou complexe de Golgi, a deux faces ou faces, la face cis et la face trans, comme décrit dans « La cellule : une approche moléculaire ».
L'appareil de Golgi récupère les protéines transportées dans des vésicules formées dans le réticulum endoplasmique. L'organite modifie ensuite ces protéines en coupant certaines sections ou en ajoutant les molécules nécessaires. Une vésicule se forme alors autour de la protéine, pince l'appareil de Golgi et se rend là où la protéine est nécessaire. La face cis de l'appareil de Golgi se trouve près du réticulum endoplasmique pour recevoir ses produits. La face trans de l'organite est positionnée près de la membrane plasmique, prête à transporter la protéine finie hors de la cellule.
