Un Dogue Allemand merle est un chien de la race Dogue Allemand qui a un pelage tacheté composé d'un fond gris ou crème clair et de petites taches noires. Les Dogues Allemands Merle sont souvent produits lors de la reproduction pour Grands Danois à pelage arlequin, chiens qui ont des taches noires sur la fourrure blanche.
Bien que la génétique du merle soit associée à la génétique des chiens à motif arlequin, l'arlequin est un motif de pelage reconnu pour la race, contrairement au merle. C'est pour décourager l'élevage de chiens merle, car les chiens qui sont le produit de deux parents merle sont souvent mort-nés, ou ils sont nés sourds et aveugles. Le gène merle affecte la production de mélanine, une molécule responsable de la pigmentation, de la vue et de l'ouïe. Les chiens qui reçoivent une copie du gène de chaque parent sont homozygotes pour le merle. Ils n'ont pas de gènes sains pour compenser les effets, ils développent donc des anomalies congénitales.