Certaines espèces de chauves-souris hibernent et d'autres sont actives toute l'année. Les chauves-souris qui vivent dans des zones où les insectes meurent pendant l'hiver ont tendance à hiberner en raison de l'épuisement des sources de nourriture, et les chauves-souris dans les zones tropicales avec les proies fiables toute l'année n'hibernent généralement pas.
Les chauves-souris se roulent en boules pendant l'hibernation, et elles hibernent généralement sur les murs ou les plafonds des grottes. Certaines espèces de chauves-souris hibernent jusqu'à six mois, ne subsistant qu'avec quelques grammes de réserves de graisse. Leur capacité à faire baisser leur température corporelle et à ralentir leur métabolisme et leur rythme cardiaque leur permet d'hiberner aussi longtemps. Les chauves-souris perdent généralement environ la moitié de leur poids corporel total pendant l'hibernation.
