Venise s'enfonce parce que la plaque adriatique sous la ville s'enfonce sous les Apennins en raison de la tectonique des plaques et de la compaction lente des sédiments qui soutiennent la ville. L'un ou les deux de ces processus sont également provoquant une légère inclinaison de la ville vers l'Est. Historiquement, le pompage des eaux souterraines sous la ville a également contribué au naufrage, mais ce pompage a été arrêté.
Venise coule à un rythme d'environ 0,08 pouce par an. Le niveau de la mer autour de Venise augmente presque au même rythme, ce qui aggrave le problème. La ville et la terre des lagunes environnantes s'enfoncent. Les mesures satellitaires entre les années 2000 et 2009 ont indiqué que le naufrage s'était arrêté après l'arrêt du pompage des eaux souterraines, mais les techniques GPS ultérieures ont révélé que la ville avait continué à couler.
En conséquence du naufrage de la ville et de l'élévation du niveau de la mer, les inondations sont de plus en plus fréquentes à Venise. Les passerelles en planches doivent désormais être utilisées plusieurs fois par an pour permettre aux résidents de traverser de grandes parties de la ville. La principale solution actuellement à l'étude est une série de vannes, conçues pour empêcher l'eau d'entrer pendant les marées montantes.