Les preuves de théories sont limitées aux systèmes autonomes de logique analytique et de mathématiques, tandis que la science explique la nature comme un tout dynamique. Les preuves sont finales et binaires - deux caractéristiques qui ne peuvent pas exister dans quelque chose d'aussi vivant et changeant que la science. De plus, les théories peuvent être falsifiées lorsque de nouvelles preuves sont découvertes.
Une théorie est acceptée par les scientifiques lorsqu'elle existe comme la meilleure explication parmi d'autres alternatives, s'il y en a. L'acceptation d'une théorie dépend de l'émergence d'une meilleure ou de sa falsification par de nouvelles preuves. Même le fait scientifique, qui est défini par The Free Dictionary comme une observation confirmée acceptée comme vérité, n'est pas définitif.
Le but de la science est d'expliquer la nature et d'éliminer les théories rivales. Certaines théories scientifiques sont plus largement acceptées car elles sont soit les meilleures explications d'un phénomène, soit simplement plus crédibles. Cependant, la crédibilité n'est pas un véritable critère scientifique.
Même si une théorie est falsifiée, cela ne signifie pas nécessairement que le phénomène auquel elle appartient est également remis en question. Par exemple, la théorie de la gravité est une explication du fonctionnement de la gravité, mais si elle s'avérait imparfaite, cela ne signifierait pas que la gravité n'existe pas du tout.