Les reptiles sont importants car ils jouent un rôle vital dans le réseau trophique, agissant comme pollinisateurs et contrôlant les parasites. Les reptiles sont des prédateurs pour certains animaux et des proies pour d'autres, ce qui en fait un élément essentiel de l'écosystème .
Les alligators américains sont une espèce importante car ils creusent des "trous d'alligator" dans les zones qu'ils habitent, qui contiennent la seule eau disponible pendant la saison sèche dans les Everglades. Ces petits points d'eau servent de refuge à d'autres animaux aquatiques et de source d'eau pour les plantes, les oiseaux et les animaux. Un reptile étroitement lié, le crocodile, est considéré comme une espèce clé car il est très influent dans son habitat.
En plus d'être essentiels aux réseaux trophiques de nombreux écosystèmes différents, les reptiles peuvent également remplir de nombreux autres rôles importants. Par exemple, certains reptiles agissent comme des pollinisateurs. Le gecko diurne à queue bleue pollinise une espèce rare de plante située à Maurice. En tant que seul pollinisateur, le gecko est essentiel à la survie de la plante. Les reptiles servent également à contrôler les espèces nuisibles et les rongeurs, ce qui profite aux communautés agricoles où les nuisibles peuvent détruire les récoltes.
Bien que les reptiles soient une partie positive de l'écosystème, leur survie est menacée par les humains, la perte d'habitat et le changement climatique. Souvent, les reptiles sont mis en péril par des espèces envahissantes qui sont introduites dans un environnement et prennent le dessus.
