Les parasites, notamment les acariens trachéaux et varroa, qui ont été introduits en Amérique du Nord dans les années 1980, sont la principale cause de la disparition des abeilles mellifères. Ces parasites provoquent des maladies qui peuvent être nocives pour les colonies d'abeilles, comme une maladie qui fait émerger des abeilles nouvellement élevées avec des ailes mal formées et l'incapacité de voler.
Bien que des acaricides efficaces contre ces acariens aient été développés, les acariens commencent à développer une résistance aux produits chimiques, à partir de 2015. Les scientifiques développent une souche d'abeilles résistantes aux acariens dans l'espoir de repeupler les abeilles dans les zones touchées.
Les autres causes du déclin de la population d'abeilles sont la déforestation et la destruction des habitats indigènes en raison de la construction de parkings, de centres commerciaux et d'autres structures.