La persécution a augmenté parce que l'Église catholique était mécontente des nouvelles idées apportées par la Réforme et voulait écraser toute opposition. Pendant la Réforme, la violence était le principal moyen d'arrêter les révolutions ou de nouveaux changements radicaux .
La Réforme a eu lieu au 16ème siècle et a traité les différentes idées du christianisme. De nombreux chrétiens étaient mécontents de l'Église catholique pour des raisons telles que le fait de permettre au pape d'établir toutes les règles et d'être l'autorité ultime sur les pratiques chrétiennes. Ces chrétiens ont développé leur propre ensemble de règles et ont défié les règles catholiques.
L'un des chefs de file de la Réforme les plus en vue était Martin Luther. La contribution de Luther à la religion chrétienne deviendra plus tard connue sous le nom de dénomination luthérienne. De nombreuses dénominations différentes sont nées de la Réforme protestante.
On pense que Luther a commencé la Réforme lui-même avec son traité intitulé "95 thèses". Le document a été publié en 1517 et s'est répandu rapidement en raison de l'invention de l'imprimerie. Dans la publication, Luther a déclaré qu'il croyait que l'église devait être purifiée et se concentrer à nouveau sur la Bible plutôt que sur la tradition. Ce n'était pas une idée nouvelle, mais c'était une idée qui n'avait pas été entendue publiquement et cela a aidé à organiser le peuple.