Les coyotes ne sont pas des prédateurs au sommet et ont des ennemis. Les loups chassent ou tuent souvent les coyotes qui envahissent leur territoire, les coyotes ont donc tendance à éviter les zones où vivent les loups. Les agriculteurs et les éleveurs considèrent souvent les coyotes comme une nuisance et exterminent activement les coyotes, et certaines personnes chassent les coyotes pour se divertir.
Historiquement, les coyotes évitaient les zones où vivaient des meutes de loups. Cependant, depuis la décimation des loups dans la majeure partie de leur aire de répartition historique, les coyotes ont considérablement élargi leur aire de répartition. Les coyotes se trouvent maintenant plus fréquemment dans les zones boisées et montagneuses, alors qu'auparavant, ces régions étaient dominées par les loups. Les coyotes se sont également étendus à des zones plus urbaines, où ils se nourrissent de déchets et d'animaux domestiques.
