Les acides aminés de forme libre ne contiennent pas de liaisons peptidiques car ils sont les éléments constitutifs des monomères des protéines. Comme expliqué par le Dr John W. Kimball, des liaisons peptidiques se forment entre deux acides aminés, créant de longues chaînes polypeptidiques. Les protéines sont composées d'une ou plusieurs de ces chaînes polypeptidiques.
Vingt acides aminés différents sont utilisés pour synthétiser les protéines. Les acides aminés se composent d'un atome de carbone alpha central, d'un atome d'hydrogène, d'un groupe carboxyle, d'un groupe amino et d'un groupe fonctionnel qui détermine le type d'acide aminé. Kimball explique que pendant la synthèse des protéines, une liaison peptidique liée de manière covalente se forme entre le groupe carboxyle d'un acide aminé et le groupe aminé de l'acide aminé séquentiel suivant.