Les hippocampes sont éclos à partir d'œufs pondus par l'hippocampe femelle. Les œufs sont portés par l'hippocampe mâle jusqu'à leur éclosion.
L'hippocampe effectue une danse nuptiale en saison. Cette danse peut prendre jusqu'à 8 heures. Une fois la danse terminée, la femelle pond ses œufs dans la poche d'un hippocampe mâle. Lorsque les œufs sont dans la poche, le mâle les féconde et les porte.
La femelle peut pondre jusqu'à 2 000 œufs à la fois. Après 10 à 25 jours, les œufs éclosent et le mâle s'occupe des alevins dans la poche. Une fois qu'elles ont grandi, le mâle a des contractions et les relâche dans l'eau.