Les hippocampes mâles mettent bas en relâchant leur jeune progéniture dans l'eau une fois les œufs éclos. Les œufs fécondés sont stockés dans une poche à couvain sur la face ventrale de l'animal pendant une période de gestation allant de 14 jours à quatre semaines.
Lors de l'accouplement, la femelle dépose ses œufs dans la poche, qui sont ensuite fécondés à l'intérieur par le mâle. Le nombre d'œufs varie de 50 à 150 chez les petites espèces jusqu'à 1 500 chez les plus grands hippocampes. Les hippocampes sont uniques en ce sens qu'ils s'accouplent par paires pour la vie et sont la seule espèce animale sur la planète dans laquelle le mâle porte les jeunes à naître.
