La déforestation réduit le recyclage de l'eau de la terre vers l'atmosphère et inversement jusqu'à 75 %. L'hydrosphère se compose de toutes les différentes formes d'eau sur la Terre, et la déforestation modifie radicalement l'eau de la Terre contenu en réduisant l'évaporation et l'humidité du sol.
La déforestation influence l'hydrosphère en augmentant les inondations. Lorsque le bois disparaît d'une zone forestière, les inondations augmentent en raison de la diminution du nombre d'obstacles à l'eau. Cela a des répercussions sur la qualité de l'eau et la stabilité du sol. Les inondations modifient le cours des rivières et autres plans d'eau. L'impact des changements de l'hydrosphère sur les régimes climatiques reste également à l'étude.
Dans la forêt amazonienne, 75 % de l'eau qui tombe sous forme de pluie respire directement dans l'atmosphère ou s'évapore, tombant à nouveau sous forme de pluie. Dans la forêt tropicale, un acre renvoie environ 76 000 litres d'eau dans l'atmosphère pour créer des nuages, qui précipitent et forment à nouveau de la pluie. C'est ce recyclage qui donne à la forêt tropicale ses caractéristiques d'eau élevée. La déforestation dans la forêt tropicale perturbe considérablement ce cycle. Les sols s'assèchent, moins d'eau retourne dans l'atmosphère et la pluie tombe de manière moins importante.
