L'objet de "Clue Jr. : The Case of the Missing Cake" est de naviguer à travers des indices pour identifier qui a mangé le gâteau, quand le gâteau a été mangé et quelle boisson a été consommée avec le gâteau. Le jeu est recommandé pour deux à six joueurs âgés de 5 à 8 ans, et il se compose du plateau de jeu, des pions personnages et meubles, une toupie, des socles de joueurs, des cartes mystères et un bloc-notes de détective.
Les joueurs commencent par choisir un moteur ou une base de joueur et le placent sur la couleur correspondante sur le plateau de jeu. Le premier joueur fait tourner la roulette et avance du nombre d'espaces affichés sur la roulette. Si les joueurs atterrissent sur un espace déjà occupé, l'espace est ignoré ou les joueurs peuvent choisir d'attendre pour regarder dans la pièce sur le plateau de jeu. En atterrissant sur une case attenante à une pièce, les joueurs peuvent déverrouiller le trou de la serrure et découvrir les indices dans la pièce. À l'aide du bloc-notes de détective, les joueurs doivent noter des indices et des suppositions tout en se déplaçant sur le plateau de jeu. Une fois qu'un joueur est prêt à deviner qui a mangé le gâteau, où il a été mangé et quelle boisson a été consommée, ce joueur doit annoncer la conjecture et a la possibilité de voir la carte mystère pour voir si la conjecture est correcte. Si la conjecture est correcte, le joueur gagne la partie. Sinon, le joueur doit remettre la carte et le jeu reprend avec les autres joueurs.