Selon Vetstreet, les chihuahuas vivent de 12 à 20 ans. Les chihuahuas en bonne santé ont l'une des durées de vie les plus longues de toutes les races de chiens. Ils sont également la plus petite race et la seule race naturelle de la taille d'un jouet.
Bien que le Chihuahua puisse profiter d'une longue vie, il existe de nombreux problèmes de santé qui ont tendance à affecter ces chiens. Comme beaucoup de petits chiens, les Chihuahuas peuvent développer un collapsus trachéal, ce qui provoque une grave obstruction des voies respiratoires. De nombreux Chihuahuas ont une molera, une tache molle ouverte sur le crâne qui ne se ferme jamais complètement, ce qui peut entraîner des blessures à la tête, des convulsions et la mort. Certains Chihuahuas ont un shunt portosystémique, une anomalie congénitale qui fait que le sang est détourné du foie et conduit à une accumulation mortelle de toxines.