Le Chihuahua moderne à poil court est originaire de Chihuahua, au Mexique, dans les années 1850. Les origines anciennes de la race sont débattues, mais les historiens pensent que les Chihuahuas ont été découverts pour la première fois au Mexique, en Amérique centrale ou en Amérique du Sud.
Une théorie suggère que les Chihuahuas descendent du chien Techichi d'Amérique du Sud, qui a été représenté dans les sculptures toltèques du IXe siècle. Les illustrations de Techichis dépeignaient des caractéristiques similaires aux Chihuahuas, y compris leurs têtes rondes et leurs grandes oreilles. La population Techichi a été assimilée à la culture aztèque après la conquête des Toltèques, mais elle a progressivement diminué lors de la conquête espagnole. Les Aztèques croyaient que les chiens Techichi étaient des guides clairvoyants du monde souterrain et les ont loués comme symboles de mysticisme et de guérison.