Les races de chevaux domestiques ont 64 chromosomes. Le cheval de Przewalski, la seule race de cheval sauvage encore connue, possède 66 chromosomes. Malgré cette différence, les deux races de chevaux sont capables de s'accoupler et de produire une progéniture fertile.
Cartographié en 2007 par le Horse Genome Project, le matériel génétique d'un cheval comprend 2,7 milliards de paires de bases d'ADN à l'intérieur de chaque chromosome. D'autres animaux avec 64 chromosomes sont le chinchilla, le renard fennec et la mouffette tachetée. Les ânes, qui ont 62 chromosomes, sont élevés avec le cheval domestiqué pour produire des mules, qui ont 63 chromosomes. En raison de ce nombre impair, la plupart des mules sont stériles.
