Selon la Worldmark Encyclopedia of Nations, le découvreur européen des Philippines était Ferdinand Magellan. Il a découvert les Philippines le 15 mars 1521. Les preuves de l'occupation humaine des îles remontent à il y a 250 000 ans.
Les experts pensent que les Negritos ont traversé des ponts terrestres de Bornéo et Sumatra aux Philippines il y a environ 30 000 ans. Les Malais étaient plus tard des migrants du sud, dépassant finalement en nombre les Negritos. Les commerçants arabes ont pris contact avec les îles du sud des Philippines au 14ème siècle. Magellan a tenté de revendiquer les îles pour l'Espagne après les avoir découvertes en 1521, mais a été tué au combat par le chef philippin Lapulapu. L'Espagne a lancé une invasion des îles en 1565.